ストーリー
嘉永６年６月３日、アメリカ太平洋艦隊のペリーが、開国を求めて浦賀に来航し、日本国内に衝撃を与えた。
さらにロシアからはプチャーチンが長崎に来航、欧米列強の勢力がついに、しかし来たるべくして鎖国日本に届いた。
この難局に当たり、老中安部正弘は諸藩の意見を広く求めた。すでにこの時期、弱体化した幕府の力だけでは対処できないほど日本を取りまく状況は複雑であり、また幕府の威信は衰えていたのである。
列強諸国からの開国要求の圧力のなかで、局面打開の名案も浮かばないまま、圧倒的な武力を背景とするペリーに屈するように、翌年春にはついに日米和親条約が締結された。
世論はにわかに沸騰しはじめた・・・
人びとは弱腰幕府のふがいなさに憤慨し、公然と幕府批判をおこなうものも出てきた。
雄藩の発言力が台頭してくるのもこの頃である。
将軍の継嗣問題・条約締結の勅許という２大政治問題が未解決のまま、老中阿部を失った幕府は、さらにこれと前後してアメリカ総領事ハリスの再三再四にわたる通商条約締結要求に、なすすべも実力もないまま、日本は、ついにその重い鎖国の扉を開きはじめようとしていた。
（ゲームのプロローグより抜粋）
ゲームの目的
プレイヤーは幕末の動乱期にあった日本を舞台として活躍した志士になり代わり、国力の衰退した日本を救うために、自分の信じる思想に日本全国を変えていこうとするゲームです。
自分の信じる思想を広めるためには、様々な人々と議論や、ときには戦闘を行い、最終的に当時有数の権力を持っていた全国13ヶ所の雄藩の思想を自分の信じる思想に統一し、佐幕思想は将軍、公儀思想は将軍と天皇、尊王思想は天皇に謁見するとクリアとなります。
ゲームのシナリオは３種類あり、それぞれ選択できるキャラクターが違います。
| シナリオ１ 新時代の幕開け 嘉永6年（1858）1月28日 |
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| 佐幕派 | 公儀派 | 尊王派 |
| 小栗忠順 | 坂本龍馬 | 西郷隆盛 |
| 松平容保 | 勝海舟 | 桂小五郎 |
| 井伊直弼 | 島津斉彬 | 吉田松陰 |
| シナリオ２ 長州の攘夷実行 文久3年（1863）5月10日 |
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| 佐幕派 | 公儀派 | 尊王派 |
| 小栗忠順 | 坂本龍馬 | 西郷隆盛 |
| 松平容保 | 勝海舟 | 桂小五郎 |
| 近藤勇 | 松平慶永 | 高杉晋作 |
| シナリオ３ 明治維新の戦乱 慶応3年（1867）11月15日 |
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| 佐幕派 | 公儀派 | 尊王派 |
| 小栗忠順 | 坂本龍馬 | 西郷隆盛 |
| 松平容保 | 勝海舟 | 桂小五郎 |
| 河井継之助 | 松平慶永 | 岩倉具視 |
雄藩とシナリオ別の藩主
| 藩名 | 藩主 | ||
| シナリオ１ | シナリオ２ | シナリオ３ | |
| 仙台藩（陸前） | 伊達慶邦 | 伊達慶邦 | 伊達慶邦 |
| 長岡藩（長岡） | 牧野忠恭 | 牧野忠恭 | 牧野忠恭 |
| 会津藩（会津） | 松平容保 | 松平容保 | 松平容保 |
| 水戸藩（水戸） | 徳川慶篤 | 徳川慶篤 | 徳川慶篤 |
| 福井藩（越前） | 松平慶永 | 松平直廉 | 松平直廉 |
| 尾張藩（尾張） | 徳川義勝 | 徳川義宜 | 徳川義宜 |
| 桑名藩（桑名） | 松平春猷 | 松平定敬 | 松平定敬 |
| 彦根藩（近江） | 井伊直弼 | 井伊直憲 | 井伊直憲 |
| 芸州藩（安芸） | 浅野斎粛 | 浅野長訓 | 浅野長訓 |
| 長州藩（防長） | 毛利敬親 | 毛利敬親 | 毛利敬親 |
| 土佐藩（土佐） | 山内容堂 | 山内豊範 | 山内豊範 |
| 佐賀藩（佐賀） | 鍋島閑叟 | 鍋島閑叟 | 鍋島直大 |
| 薩摩藩（薩摩） | 島津斉彬 | 島津忠義 | 島津忠義 |
なお、尊王思想でプレイをする場合は会津藩、佐幕思想でプレイをするときは長州藩の藩主は思想が完全に固定されているので、説得で藩主の思想を変化させることができません。
よって、それぞれの藩を武力制圧する必要があります（公儀思想は両方とも説得できます）。
メイン画面の説明
１
要人以外の一般の人物です。主な身分として武士、志士、町人、農民、女などがいます。
数字は人数を表しており、女意外は同志説得で仲間にすることが可能です。また、これらの人物は突然攻撃をしてきたり、武士は思想の説得にもやってくることもあります。まれに僧、学者、公家、同心、外人なども現れますが、彼らは同志説得に応じないことが多いです。
要人や一般人物共に全ての人物はメイン画面では名前の先頭一文字、人数（同志数）、人物の身分に応じたグラフィックで表示されます。
２
点滅しているキャラクターが現在自分で動かせるキャラクターです。
３
アイコン内の文字が、上記の「１」以外の人物が要人です。要人は情報コマンドを使用することで、ステータスの詳細を確認することができます。「武市半平太」などはメイン画面でも「武」と表示されるので、武士と間違えやすく紛らわしいです。
４
現在の年や、現在地、何藩の所領かと言う情報です。
５
現在の日付と時間を表しています。維新の嵐では１日ずつゲームが進み、１日も朝、昼、夕、夜に分かれていて４回の行動が可能です。
６
現在行動中のキャラクターの簡易ステータスです。
名前、身分、同志数、体力、グラフィックが表示されます。
７
イベントが発生した際にグラフィックが表示されるウインドウです。７ イベントが発生した際にグラフィックが表示されるウインドウです。
８
現在使用可能なコマンドが表示されます。
維新の嵐ではメイン画面の状態で何もしないでいると、勝手に時間が過ぎてしまいます。
情報画面や機能画面を出した状態だと、時間が停止するので、席を立つときは情報画面にしておきましょう。
コマンドの説明
スクエアモードの説明
| １ | 点滅している個所が、現在地を示します。 |
| ２ | 地域の境界線が赤線で示されます。 この画像では、分かりやすくするために赤線を太く加工してあり、実際はもっと細い線になります。 |
| ３ | 現在いる地域を示しています。 地域は東北１、東北２、関東、信越、近畿、中四国、九州の7地域に分かれています。 |
スクエアモードでは要人の体力に応じて、1日に1～4マップまで移動することが可能です。この機能を使用することで、遠くの地へもすばやく移動することができるようになります。
しかし、高い山や海は越えることができないので、山は回り道を行い、海はヘクスモードに切り替えて港を利用する必要があります。
また、地域の境界線（赤い線）を越えると体力が残っていても、その日の行動は終了となります。他の要人が説得や戦闘にきた場合は、強制的にヘクスモードに戻されてしまいます。